Na Faculdade de Oceanografia a formação e qualificação do profissional oceanógrafo fundamenta-se primeiramente numa grade curricular inter e multidisciplinar articulada em torno das áreas de conhecimento científico que compõem a Oceanografia (Oceanografia Biológica, Geológica, Física e Química), áreas correlatas (p. ex., Meteorologia, Climatologia, Cartografia, Ciência da Computação) e na interação entre as atividades de ensino, pesquisa e extensão. O Curso de Oceanografia da UERJ tem a duração de 5 anos sendo oferecido em regime integral (manhã e tarde). Dado o seu caráter inter e multidisciplinar, a formação do profissional oceanógrafo exige primeiramente a capacitação em diferentes áreas das ciências elementares (Biologia, Física, Geologia, Química, Matemática e Estatística, Climatologia, Meteorologia, Cartografia).
Esta capacitação é oferecida durante o ciclo básico de formação (2 anos de duração), que é seguido pelo aprofundamento e aplicação desses conhecimentos ao ambiente marinho, durante o ciclo profissional (3 anos de duração), o qual inclui a elaboração e defesa da monografia de final de curso.